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医療の国際展開の促進を目指し、MEJは各種認証を行っています。
MEJは、日本の医療機関に渡航受診者の受入れを促進するため、渡航受診者の受入れに意欲と取組みのある病院を「ジャパン インターナショナル ホスピタルズ」として推奨し、政府と協調して海外へ情報発信しています。
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認証医療渡航支援企業（AMTAC）とは、医療国際展開タスクフォースにて策定されたガイドラインの基準を満たす医療渡航支援企業に与えられる総称です。政府の医療国際展開タスクフォースにて策定されたガイドラインに基づき、MEJは認証組織としてAMTACを認証しています。
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JIH連携医療機関とは、JIHと連携して、より効率的・効果的な医療を患者に提供すること（病診連携）を望み、MEJが策定した基準を満たす新興国の医療機関に与えられる総称です。国際的な病診連携を通じて医療の国際展開を促進するため、MEJはJIH連携医療機関を認証しています。
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